Computational Modeling of Protein-Ligand Interactions

The team’s work, prior to 2019, was carried out within the UMRS Paris Diderot-Inserm 973 (MTi)

 

Defended PhD Theses since 2012

2023

Mariem GHOULA – Equipe Modélisation Computationnelle des Interactions Protéine Ligand
Soutenance le 10/07/2023
Sujet : Analyse Bioinformatique de protéines thérapeutiques: étude des protéines partenaires du Facteur de Préimplantation (PIF) et des protéines du SARS-CoV-2.

Sarah NACERI – Equipe Modélisation Computationnelle des Interactions Protéine Ligand
Soutenance le 02/06/2023
Sujet : Exploration structurale des protéines pour leur validation en tant que cibles thérapeutiques.

2022

Bryan DAFNIET – Equipe Modélisation Computationnelle des Interactions Protéine Ligand
Soutenance le 15/12/2022
Sujet : Identification des interactions médicamenteuses délétères et des variations génomiques structurales entraînant des effets secondaires chez l’homme à l’aide d’outils d’apprentissage automatique.

Emilie GUILLOCHON – Equipe Modélisation Computationnelle des Interactions Protéine Ligand
Soutenance le 9/11/2022
Sujet : Étude du transcriptome de Plasmodium falciparum dans un contexte de paludisme cérébral.

 

2021

Pierre LAVILLE
Soutenance le 15/10/2021
Sujet : Étude des mécanismes de résistance du VIH-2 pour les inhibiteurs de protéase en utilisant des approches de bioinformatique structurale.

 

2019

Natacha CERISIER
Soutenance le 24/09/2019
Sujet : Modélisation des interactions protéines-effecteurs et développement de méthodes de prédiction de ces interactions.

2018

Dhoha TRIKI

Soutenance le 6/04/2018

Sujet : Étude des mécanismes de résistance naturelle de la protéase de VIH-2 (PR2) contre les inhibiteurs de protéase par des approches de bioinformatique structurale pour la recherche d’inhibiteurs ciblés de PR2

Ikram ALLAM

Soutenance 01/2018

Sujet : Développement d’un alphabet structural protéique adapté aux problématiques du Drug Design et à la recherche des motifs fonctionnels

 

2017

Grace SHEMA NZABONIMPA

Soutenance le 20/12/2017

Sujet : Pharmacogenomics and personalized medicine in the treatment of ADHD

Stéphanie EUSTACHE

Soutenance le 01/02/2017

Sujet : Étude de la protéine ribosomale el42 : analyse fonctionnelle de mutations, méthylations et interactions avec des ligands.

 

2016

Carlyl RIBEIRO LIMA
Soutenance le 16/12/2016
Sujet: Structural modeling and characterization of target specifics of Trypanosoma cruzi, etiologic agent of Chagas disease.

Ines RASOLOHERY

Soutenance le 22/11/2016

Sujet: Développement d’une méthode pour la détection de cibles secondaires de ligands.

Lydia BENKAIDALI

Soutenance le 15/09/2016

Sujet : Étude et applications de nouveaux modèles géométriques des canaux d’accès au site actif de certains cytochromes P450 humains par des ligands volumineux.

Hiba Abi HUSSEIN

Soutenance 23/06/2016

Sujet : Chemogenomique Structurale : analyse des poches protéiques et de leur capacité à fixer des ligands, prédiction de leurs partenaires ligands potentiels

Alexandre BORREL

Soutenance 05/2016

Sujet : Modélisation des poches protéiques, de leur druggabilité et prédiction des profils de ligands associés

2015

Jens Nielsen KRINGELUM

Soutenance 12/2015

Sujet : Target Profiling of Drugs

2014

Pierre THEVENET
Soutenance le 18/09/2014
Sujet: Exploration des interactions peptide-protéine

2012

Yimin SHEN
Soutenance le 26/09/2012
Sujet: Bioinformatique appliquée à la prédiction de structure des peptides.